La Grotte des apparitions est le cœur du Sanctuaire. La source et la statue de Notre-Dame de Lourdes qu’elle abrite sont l’objet de toute l’attention des pèlerins. La Grotte, à elle toute seule, dit beaucoup du Message de Lourdes. Elle est creusée dans la roche, comme en écho à cette parole de la bible : « Le Seigneur est mon rocher, mon salut, ma citadelle » (psaume 62, 7). La roche est noire et le soleil ne pénètre jamais dans la Grotte : l’Apparition (la Vierge Marie, l’Immaculée Conception), au contraire, n’est que lumière et sourire. La niche où est posée la statue marque l’endroit où, le plus souvent, se tenait la Vierge Marie quand elle apparaissait à Bernadette Soubirous : c’est comme une fenêtre qui, de ce monde obscur, ouvre sur le Royaume de Dieu.
Grotte est un lieu de prière, de confiance, de paix, de respect, d’unité, de silence. Chacun donne à son passage dans la Grotte ou à son arrêt devant la Grotte le sens qu’il peut et qu’il veut lui donner.
Les papes Jean-Paul II et Benoît XVI sont venus prier dans cette Grotte.